NGS - надежный способ выявления мутации T790M гена EGFR у пациентов с НМРЛ

NGS, таргетное высокопроизводительное секвенирование

Группа итальянских ученых из Университета Генуи исследовала новый способ выявления мутации T790M гена EGFR циркулирующей опухолевой ДНК (цоДНК) у пациентов с немелкоклеточным раком легкого (НМРЛ). Он состоит в применении таргентного высокопроизводительного секвенирования следующего поколения (NGS).

НМРЛ – это форма рака легкого, которая встречается наиболее часто и составляет свыше 85% случаев.

Предпосылки

Наличи мутации T790M гена EGFR в циркулирующей опухолевой ДНК (цоДНК) плазмы имеет решающее значение для оценки возможности применения у пациентов с НМРЛ последующего лечения с помощью осимертиниба. Такие пациенты приобретают устойчивость к ингибиторам тирозинкиназы (ИТК) первого или второго поколения (эрлотиниб, гефитиниб, афатиниб)

Осимертиниб (препарат Тагриссо®, международная фармокомпания AstraZeneca) – это препарат, используемый для лечения немелкоклеточного рака легкого с определенной мутацией. Это пероральный необратимый ингибитор тирозинкиназы рецептора эпидермального фактора роста третьего поколения. Зарегистрирована высокая активность и хорошая переносимость осимертиниба у больных НМРЛ. В конце 2017 года препарат получил одобрение в Европе.

Поскольку цоДНК присутствует в плазме в очень низких количествах, для молекулярного анализа необходимы высокочувствительные и специфические методы. Повышение чувствительности обнаружения мутации T790M в плазме позволит гораздо большему количеству пациентов с НМРЛ получать соответствующую терапию без каких-либо дополнительных инвазивных процедур.

Методика

В исследовании была применена платформа таргентного высокопроизводительного секвенирования (NGS). Для идентификации мутации T790M она способна метить аллели ДНК редких циркулирующих опухолей. В исследовании участвовали 42 пациента с диагнозом НМРЛ после терапии ИТК первого и второго поколения.

Результаты

По сравнению с методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реальном времени (Real-Time PCR), секвенирование ДНК с применением пометки аллель (NGS) улучшило частоту обнаружения мутации T790M в два раза (42,85% против 21,4% соответственно). Эффект был особенно выражен в тех случаях, когда содержание мутации имело низкое медианное значение. Кроме того, с помощью NGS были более эффективно идентифицированы другие мутации EGFR, в частности, для варианта L858R обнаружение составило 85,7% против 61,9% (ПЦР в режиме реального времени). Пациенты, у которых в плазме была обнаружена мутация T790M, достигли объективного ответа на терапию осимертинибом (9/14, 64,28%).

Выводы

NGS представляет собой очень точный и чувствительный инструмент, позволяющий в клинических условиях провести неинвазивное выявление и мониторинг мутации варианта T790M у пациентов с немелкоклеточным раком легкого.

Авторы: Мариелла Доно, Джузеппа Де Лука, Соня Ластрайоли, Джорджия Ансельми, Мария Джованна Даль Белло, Симона Коко, Ирэн Ванни, Франческо Гросси, Антонелла Вигани, Карло Генова, Манлио Феррарини, Жан Луи Раветтии, Симона Зупо.

Источник: Molecular Medicine, BMC

Другие работы по теме:

Читайте также